Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEMP55040 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEMP55040 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GEMP55040 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GEMP55040 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GEMP55040 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEMP55040 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEMP55040 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEMP55040 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEMP55040 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEMP55040 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEMP55040 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEMP55040 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEMP55040 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMP55040 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMP55040 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMP55040 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMP55040 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMP55040 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMP55040 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMP55040 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMP55040 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMP55040 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMP55040 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GEMP55040 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GEMP55040 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GEMP55040 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEMP55040 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEMP55040 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEMP55040 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEMP55040 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEMP55040 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEMP55040 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEMP55040 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEMP55040 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEMP55040 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMP55040 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMP55040 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMP55040 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMP55040 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMP55040 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMP55040 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEMP55040 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEMP55040 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEMP55040 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEMP55040 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GEMP55040 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEMP55040 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEMP55040 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEMP55040 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GEMP55040 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEMP55040 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GEMP55040 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GEMP55040 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GEMP55040 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEMP55040 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMP55040 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMP55040 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMP55040 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMP55040 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMP55040 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEMP55040 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GEMP55040 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GEMP55040 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GEMP55040 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEMP55040 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEMP55040 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEMP55040 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEMP55040 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEMP55040 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMP55040 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMP55040 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMP55040 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMP55040 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMP55040 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMP55040 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMP55040 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMP55040 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMP55040 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEMP55040 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEMP55040 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEMP55040 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEMP55040 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEMP55040 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEMP55040 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEMP55040 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEMP55040 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEMP55040 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEMP55040 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GEMP55040 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GEMP55040 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GEMP55040 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GEMP55040 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMP55040 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMP55040 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEMP55040 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GEMP55040 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GEMP55040 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEMP55040 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEMP55040 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms