Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24CP53992 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24CP53992 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24CP53992 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms