Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-5P52952 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX2-5P52952 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NKX2-5P52952 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKX2-5P52952 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-5P52952 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-5P52952 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-5P52952 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-5P52952 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-5P52952 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-5P52952 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-5P52952 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-5P52952 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-5P52952 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-5P52952 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-5P52952 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-5P52952 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-5P52952 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-5P52952 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-5P52952 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-5P52952 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-5P52952 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-5P52952 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-5P52952 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-5P52952 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-5P52952 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-5P52952 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-5P52952 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-5P52952 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKX2-5P52952 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX2-5P52952 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX2-5P52952 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX2-5P52952 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NKX2-5P52952 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX2-5P52952 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-5P52952 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms