Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KA3P51812 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA3P51812 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA3P51812 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms