Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR5P51681 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR5P51681 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR5P51681 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR5P51681 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR5P51681 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR5P51681 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR5P51681 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR5P51681 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR5P51681 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR5P51681 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR5P51681 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR5P51681 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR5P51681 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR5P51681 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR5P51681 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR5P51681 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR5P51681 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR5P51681 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR5P51681 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR5P51681 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR5P51681 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR5P51681 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR5P51681 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR5P51681 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR5P51681 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR5P51681 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR5P51681 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR5P51681 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR5P51681 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR5P51681 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR5P51681 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR5P51681 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR5P51681 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR5P51681 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR5P51681 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR5P51681 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR5P51681 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR5P51681 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR5P51681 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR5P51681 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR5P51681 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR5P51681 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR5P51681 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR5P51681 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR5P51681 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR5P51681 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR5P51681 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR5P51681 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR5P51681 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR5P51681 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR5P51681 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR5P51681 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR5P51681 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR5P51681 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR5P51681 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR5P51681 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR5P51681 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR5P51681 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR5P51681 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR5P51681 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR5P51681 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR5P51681 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR5P51681 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR5P51681 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR5P51681 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR5P51681 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR5P51681 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR5P51681 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR5P51681 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR5P51681 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR5P51681 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR5P51681 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR5P51681 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR5P51681 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR5P51681 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR5P51681 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR5P51681 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR5P51681 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR5P51681 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR5P51681 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR5P51681 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR5P51681 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR5P51681 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR5P51681 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR5P51681 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR5P51681 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR5P51681 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR5P51681 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR5P51681 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR5P51681 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR5P51681 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR5P51681 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR5P51681 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR5P51681 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR5P51681 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR5P51681 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR5P51681 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR5P51681 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR5P51681 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms