Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2D1P51668 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2D1P51668 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2D1P51668 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2D1P51668 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2D1P51668 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2D1P51668 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2D1P51668 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2D1P51668 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms