Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CRIP1P50238 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP1P50238 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP1P50238 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms