Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM4P49221 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM4P49221 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM4P49221 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM4P49221 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM4P49221 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM4P49221 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM4P49221 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM4P49221 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM4P49221 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM4P49221 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM4P49221 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM4P49221 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM4P49221 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM4P49221 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM4P49221 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM4P49221 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM4P49221 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM4P49221 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM4P49221 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM4P49221 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM4P49221 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM4P49221 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM4P49221 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM4P49221 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM4P49221 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM4P49221 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGM4P49221 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TGM4P49221 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGM4P49221 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGM4P49221 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM4P49221 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM4P49221 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM4P49221 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM4P49221 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM4P49221 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM4P49221 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGM4P49221 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TGM4P49221 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGM4P49221 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGM4P49221 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGM4P49221 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM4P49221 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM4P49221 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM4P49221 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM4P49221 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM4P49221 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM4P49221 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM4P49221 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM4P49221 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM4P49221 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM4P49221 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM4P49221 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM4P49221 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM4P49221 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM4P49221 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM4P49221 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM4P49221 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM4P49221 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM4P49221 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM4P49221 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM4P49221 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM4P49221 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM4P49221 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM4P49221 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM4P49221 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM4P49221 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM4P49221 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM4P49221 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM4P49221 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM4P49221 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM4P49221 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM4P49221 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM4P49221 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM4P49221 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TGM4P49221 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM4P49221 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM4P49221 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM4P49221 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM4P49221 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM4P49221 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM4P49221 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM4P49221 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM4P49221 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM4P49221 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM4P49221 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM4P49221 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM4P49221 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM4P49221 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM4P49221 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms