Protein–RNA interactions for Protein: P49207

RPL34, 60S ribosomal protein L34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL34P49207 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL34P49207 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL34P49207 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL34P49207 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL34P49207 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL34P49207 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL34P49207 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL34P49207 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL34P49207 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL34P49207 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL34P49207 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL34P49207 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL34P49207 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL34P49207 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL34P49207 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL34P49207 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL34P49207 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL34P49207 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL34P49207 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL34P49207 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL34P49207 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL34P49207 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL34P49207 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL34P49207 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL34P49207 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPL34P49207 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL34P49207 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL34P49207 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL34P49207 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL34P49207 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL34P49207 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL34P49207 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL34P49207 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL34P49207 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL34P49207 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL34P49207 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL34P49207 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL34P49207 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL34P49207 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL34P49207 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL34P49207 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL34P49207 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL34P49207 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL34P49207 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL34P49207 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL34P49207 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL34P49207 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL34P49207 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL34P49207 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL34P49207 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL34P49207 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL34P49207 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL34P49207 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL34P49207 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL34P49207 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL34P49207 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL34P49207 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL34P49207 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL34P49207 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL34P49207 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL34P49207 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL34P49207 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL34P49207 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL34P49207 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL34P49207 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL34P49207 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL34P49207 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL34P49207 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL34P49207 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL34P49207 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL34P49207 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL34P49207 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL34P49207 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL34P49207 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL34P49207 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL34P49207 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL34P49207 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL34P49207 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL34P49207 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL34P49207 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL34P49207 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL34P49207 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL34P49207 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL34P49207 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL34P49207 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL34P49207 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL34P49207 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL34P49207 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL34P49207 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL34P49207 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL34P49207 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL34P49207 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL34P49207 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL34P49207 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL34P49207 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL34P49207 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL34P49207 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL34P49207 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL34P49207 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL34P49207 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms