Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX2P48378 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX2P48378 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX2P48378 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFX2P48378 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RFX2P48378 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFX2P48378 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFX2P48378 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFX2P48378 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFX2P48378 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RFX2P48378 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RFX2P48378 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFX2P48378 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFX2P48378 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFX2P48378 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFX2P48378 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFX2P48378 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFX2P48378 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFX2P48378 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFX2P48378 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFX2P48378 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFX2P48378 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFX2P48378 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX2P48378 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX2P48378 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX2P48378 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX2P48378 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX2P48378 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX2P48378 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX2P48378 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX2P48378 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX2P48378 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX2P48378 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX2P48378 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX2P48378 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX2P48378 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX2P48378 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX2P48378 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX2P48378 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX2P48378 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX2P48378 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX2P48378 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX2P48378 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX2P48378 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX2P48378 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX2P48378 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX2P48378 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX2P48378 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX2P48378 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX2P48378 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX2P48378 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX2P48378 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX2P48378 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX2P48378 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX2P48378 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX2P48378 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX2P48378 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX2P48378 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX2P48378 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX2P48378 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX2P48378 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX2P48378 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX2P48378 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX2P48378 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX2P48378 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX2P48378 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX2P48378 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX2P48378 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX2P48378 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX2P48378 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX2P48378 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX2P48378 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX2P48378 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX2P48378 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX2P48378 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX2P48378 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX2P48378 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX2P48378 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX2P48378 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX2P48378 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX2P48378 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RFX2P48378 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RFX2P48378 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX2P48378 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX2P48378 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX2P48378 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX2P48378 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX2P48378 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms