Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRA4P48169 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRA4P48169 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRA4P48169 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRA4P48169 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms