Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RANBP1P43487 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RANBP1P43487 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANBP1P43487 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms