Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL35P42766 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL35P42766 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL35P42766 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL35P42766 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL35P42766 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL35P42766 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RPL35P42766 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL35P42766 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL35P42766 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL35P42766 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL35P42766 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL35P42766 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL35P42766 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL35P42766 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL35P42766 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL35P42766 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL35P42766 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL35P42766 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL35P42766 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL35P42766 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL35P42766 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL35P42766 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL35P42766 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL35P42766 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL35P42766 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL35P42766 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL35P42766 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL35P42766 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL35P42766 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL35P42766 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL35P42766 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL35P42766 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL35P42766 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL35P42766 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL35P42766 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL35P42766 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL35P42766 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL35P42766 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL35P42766 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL35P42766 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL35P42766 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL35P42766 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL35P42766 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL35P42766 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL35P42766 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL35P42766 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL35P42766 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL35P42766 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL35P42766 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL35P42766 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL35P42766 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL35P42766 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL35P42766 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL35P42766 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL35P42766 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL35P42766 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL35P42766 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL35P42766 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL35P42766 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL35P42766 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL35P42766 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL35P42766 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL35P42766 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL35P42766 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL35P42766 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL35P42766 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL35P42766 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL35P42766 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL35P42766 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL35P42766 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL35P42766 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL35P42766 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL35P42766 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL35P42766 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL35P42766 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL35P42766 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL35P42766 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL35P42766 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL35P42766 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL35P42766 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL35P42766 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL35P42766 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL35P42766 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL35P42766 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL35P42766 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL35P42766 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RPL35P42766 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL35P42766 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL35P42766 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL35P42766 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL35P42766 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL35P42766 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL35P42766 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL35P42766 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL35P42766 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL35P42766 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL35P42766 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL35P42766 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL35P42766 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms