Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3CAP42336 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3CAP42336 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIK3CAP42336 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3CAP42336 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms