Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN7P41732 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN7P41732 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN7P41732 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN7P41732 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms