Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDH1P40925 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDH1P40925 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDH1P40925 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDH1P40925 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDH1P40925 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDH1P40925 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDH1P40925 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MDH1P40925 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDH1P40925 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDH1P40925 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDH1P40925 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDH1P40925 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDH1P40925 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDH1P40925 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MDH1P40925 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDH1P40925 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MDH1P40925 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDH1P40925 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDH1P40925 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MDH1P40925 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDH1P40925 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDH1P40925 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDH1P40925 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDH1P40925 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MDH1P40925 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MDH1P40925 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MDH1P40925 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDH1P40925 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDH1P40925 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MDH1P40925 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDH1P40925 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDH1P40925 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MDH1P40925 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDH1P40925 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDH1P40925 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDH1P40925 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDH1P40925 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MDH1P40925 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDH1P40925 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDH1P40925 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MDH1P40925 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDH1P40925 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDH1P40925 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDH1P40925 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDH1P40925 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDH1P40925 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDH1P40925 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDH1P40925 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDH1P40925 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDH1P40925 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MDH1P40925 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDH1P40925 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDH1P40925 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MDH1P40925 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDH1P40925 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDH1P40925 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MDH1P40925 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDH1P40925 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MDH1P40925 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MDH1P40925 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDH1P40925 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDH1P40925 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDH1P40925 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDH1P40925 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDH1P40925 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDH1P40925 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDH1P40925 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDH1P40925 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MDH1P40925 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MDH1P40925 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDH1P40925 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MDH1P40925 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDH1P40925 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDH1P40925 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDH1P40925 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDH1P40925 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDH1P40925 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDH1P40925 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDH1P40925 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDH1P40925 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDH1P40925 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDH1P40925 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDH1P40925 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDH1P40925 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDH1P40925 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MDH1P40925 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDH1P40925 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDH1P40925 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDH1P40925 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDH1P40925 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDH1P40925 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDH1P40925 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDH1P40925 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDH1P40925 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDH1P40925 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDH1P40925 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDH1P40925 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDH1P40925 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDH1P40925 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms