Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH1P40692 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH1P40692 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH1P40692 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH1P40692 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH1P40692 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH1P40692 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH1P40692 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MLH1P40692 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH1P40692 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH1P40692 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH1P40692 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MLH1P40692 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH1P40692 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH1P40692 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH1P40692 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH1P40692 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH1P40692 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MLH1P40692 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH1P40692 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MLH1P40692 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH1P40692 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH1P40692 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH1P40692 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MLH1P40692 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH1P40692 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH1P40692 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH1P40692 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH1P40692 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MLH1P40692 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH1P40692 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH1P40692 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH1P40692 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH1P40692 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH1P40692 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH1P40692 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH1P40692 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH1P40692 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MLH1P40692 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH1P40692 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MLH1P40692 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH1P40692 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MLH1P40692 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH1P40692 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MLH1P40692 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH1P40692 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH1P40692 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MLH1P40692 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MLH1P40692 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH1P40692 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MLH1P40692 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MLH1P40692 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MLH1P40692 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH1P40692 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MLH1P40692 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH1P40692 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MLH1P40692 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH1P40692 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH1P40692 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH1P40692 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH1P40692 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH1P40692 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH1P40692 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH1P40692 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH1P40692 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH1P40692 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH1P40692 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH1P40692 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH1P40692 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH1P40692 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH1P40692 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH1P40692 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MLH1P40692 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MLH1P40692 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MLH1P40692 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH1P40692 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH1P40692 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH1P40692 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH1P40692 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH1P40692 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH1P40692 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH1P40692 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH1P40692 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH1P40692 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH1P40692 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH1P40692 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MLH1P40692 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MLH1P40692 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MLH1P40692 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MLH1P40692 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MLH1P40692 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MLH1P40692 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MLH1P40692 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MLH1P40692 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MLH1P40692 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MLH1P40692 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MLH1P40692 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MLH1P40692 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MLH1P40692 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MLH1P40692 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms