Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VHLP40337 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VHLP40337 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VHLP40337 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VHLP40337 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VHLP40337 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VHLP40337 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VHLP40337 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VHLP40337 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VHLP40337 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VHLP40337 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VHLP40337 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VHLP40337 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VHLP40337 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VHLP40337 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VHLP40337 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VHLP40337 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VHLP40337 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VHLP40337 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VHLP40337 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VHLP40337 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VHLP40337 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VHLP40337 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VHLP40337 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VHLP40337 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VHLP40337 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VHLP40337 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VHLP40337 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VHLP40337 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VHLP40337 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VHLP40337 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VHLP40337 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VHLP40337 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VHLP40337 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VHLP40337 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VHLP40337 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VHLP40337 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VHLP40337 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VHLP40337 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VHLP40337 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VHLP40337 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VHLP40337 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VHLP40337 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VHLP40337 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VHLP40337 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VHLP40337 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VHLP40337 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VHLP40337 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VHLP40337 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VHLP40337 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VHLP40337 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VHLP40337 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VHLP40337 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VHLP40337 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VHLP40337 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VHLP40337 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VHLP40337 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VHLP40337 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VHLP40337 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VHLP40337 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VHLP40337 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VHLP40337 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VHLP40337 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VHLP40337 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VHLP40337 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VHLP40337 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VHLP40337 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VHLP40337 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VHLP40337 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VHLP40337 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VHLP40337 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VHLP40337 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VHLP40337 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VHLP40337 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VHLP40337 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VHLP40337 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VHLP40337 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VHLP40337 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VHLP40337 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VHLP40337 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VHLP40337 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VHLP40337 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VHLP40337 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VHLP40337 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VHLP40337 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VHLP40337 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VHLP40337 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VHLP40337 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VHLP40337 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VHLP40337 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VHLP40337 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VHLP40337 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VHLP40337 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VHLP40337 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VHLP40337 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VHLP40337 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VHLP40337 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VHLP40337 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VHLP40337 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VHLP40337 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms