Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB10P40306 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB10P40306 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB10P40306 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB10P40306 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms