Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEACAM3P40198 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEACAM3P40198 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEACAM3P40198 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEACAM3P40198 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEACAM3P40198 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CEACAM3P40198 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM3P40198 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM3P40198 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms