Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms