Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM4P33991 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM4P33991 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM4P33991 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM4P33991 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM4P33991 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM4P33991 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM4P33991 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM4P33991 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM4P33991 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM4P33991 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
MCM4P33991 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MCM4P33991 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM4P33991 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM4P33991 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM4P33991 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM4P33991 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM4P33991 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM4P33991 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM4P33991 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM4P33991 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM4P33991 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM4P33991 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM4P33991 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM4P33991 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM4P33991 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM4P33991 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM4P33991 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM4P33991 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM4P33991 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM4P33991 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MCM4P33991 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM4P33991 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM4P33991 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM4P33991 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM4P33991 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM4P33991 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM4P33991 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM4P33991 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM4P33991 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM4P33991 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM4P33991 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM4P33991 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM4P33991 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM4P33991 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM4P33991 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM4P33991 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM4P33991 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM4P33991 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM4P33991 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM4P33991 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM4P33991 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM4P33991 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM4P33991 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM4P33991 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM4P33991 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM4P33991 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM4P33991 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM4P33991 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM4P33991 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MCM4P33991 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM4P33991 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM4P33991 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM4P33991 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM4P33991 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM4P33991 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM4P33991 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM4P33991 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM4P33991 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM4P33991 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM4P33991 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM4P33991 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM4P33991 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM4P33991 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM4P33991 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM4P33991 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM4P33991 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM4P33991 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM4P33991 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM4P33991 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM4P33991 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM4P33991 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM4P33991 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM4P33991 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM4P33991 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
MCM4P33991 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM4P33991 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM4P33991 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM4P33991 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM4P33991 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM4P33991 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM4P33991 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM4P33991 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM4P33991 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM4P33991 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM4P33991 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM4P33991 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM4P33991 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM4P33991 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM4P33991 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms