Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL1P33121 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSL1P33121 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSL1P33121 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSL1P33121 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms