Protein–RNA interactions for Protein: P30531

SLC6A1, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A1P30531 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A1P30531 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A1P30531 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A1P30531 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A1P30531 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A1P30531 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A1P30531 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A1P30531 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A1P30531 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A1P30531 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A1P30531 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A1P30531 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A1P30531 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A1P30531 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A1P30531 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A1P30531 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A1P30531 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A1P30531 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A1P30531 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A1P30531 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A1P30531 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A1P30531 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A1P30531 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A1P30531 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A1P30531 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A1P30531 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A1P30531 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A1P30531 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A1P30531 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A1P30531 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A1P30531 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A1P30531 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms