Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC25CP30307 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC25CP30307 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC25CP30307 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms