Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNGA1P29973 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGA1P29973 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGA1P29973 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms