Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD40LGP29965 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD40LGP29965 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD40LGP29965 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms