Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRABP1P29762 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRABP1P29762 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms