Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LMOD1P29536 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMOD1P29536 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMOD1P29536 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms