Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM5AP29375 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5AP29375 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM5AP29375 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5AP29375 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5AP29375 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms