Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB9P28065 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMB9P28065 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB9P28065 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms