Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR1P25024 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR1P25024 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR1P25024 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms