Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNE1P24864 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCNE1P24864 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNE1P24864 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNE1P24864 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNE1P24864 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNE1P24864 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNE1P24864 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNE1P24864 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNE1P24864 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNE1P24864 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNE1P24864 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNE1P24864 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNE1P24864 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNE1P24864 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNE1P24864 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNE1P24864 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNE1P24864 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNE1P24864 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCNE1P24864 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNE1P24864 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCNE1P24864 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNE1P24864 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNE1P24864 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNE1P24864 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms