Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SP100P23497 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP100P23497 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SP100P23497 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP100P23497 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP100P23497 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP100P23497 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP100P23497 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP100P23497 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP100P23497 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP100P23497 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP100P23497 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP100P23497 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP100P23497 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP100P23497 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP100P23497 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP100P23497 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP100P23497 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP100P23497 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP100P23497 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP100P23497 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP100P23497 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP100P23497 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP100P23497 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SP100P23497 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP100P23497 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP100P23497 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP100P23497 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP100P23497 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP100P23497 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP100P23497 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP100P23497 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP100P23497 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP100P23497 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP100P23497 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP100P23497 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP100P23497 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP100P23497 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP100P23497 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SP100P23497 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SP100P23497 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP100P23497 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP100P23497 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP100P23497 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP100P23497 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP100P23497 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP100P23497 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP100P23497 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP100P23497 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SP100P23497 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP100P23497 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP100P23497 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP100P23497 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP100P23497 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP100P23497 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP100P23497 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP100P23497 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP100P23497 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP100P23497 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP100P23497 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP100P23497 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SP100P23497 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP100P23497 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP100P23497 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SP100P23497 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms