Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DPA1P20036 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DPA1P20036 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DPA1P20036 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DPA1P20036 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms