Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKB1P19838 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKB1P19838 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKB1P19838 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms