Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPL17P18621 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPL17P18621 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPL17P18621 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPL17P18621 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPL17P18621 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPL17P18621 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPL17P18621 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPL17P18621 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPL17P18621 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPL17P18621 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPL17P18621 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPL17P18621 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL17P18621 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL17P18621 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL17P18621 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL17P18621 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL17P18621 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL17P18621 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL17P18621 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL17P18621 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL17P18621 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL17P18621 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL17P18621 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL17P18621 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL17P18621 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL17P18621 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPL17P18621 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPL17P18621 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPL17P18621 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPL17P18621 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL17P18621 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL17P18621 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL17P18621 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL17P18621 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL17P18621 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL17P18621 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL17P18621 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL17P18621 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL17P18621 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL17P18621 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL17P18621 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL17P18621 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL17P18621 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL17P18621 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL17P18621 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL17P18621 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL17P18621 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL17P18621 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL17P18621 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL17P18621 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL17P18621 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL17P18621 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL17P18621 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL17P18621 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL17P18621 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL17P18621 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL17P18621 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL17P18621 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL17P18621 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL17P18621 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL17P18621 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL17P18621 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL17P18621 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL17P18621 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL17P18621 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL17P18621 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL17P18621 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL17P18621 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL17P18621 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL17P18621 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL17P18621 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL17P18621 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL17P18621 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL17P18621 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL17P18621 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL17P18621 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL17P18621 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL17P18621 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPL17P18621 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL17P18621 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL17P18621 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL17P18621 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL17P18621 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL17P18621 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL17P18621 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL17P18621 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL17P18621 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL17P18621 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL17P18621 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms