Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMD1P17707 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMD1P17707 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMD1P17707 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMD1P17707 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AMD1P17707 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMD1P17707 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMD1P17707 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMD1P17707 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMD1P17707 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMD1P17707 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMD1P17707 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMD1P17707 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMD1P17707 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AMD1P17707 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMD1P17707 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMD1P17707 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMD1P17707 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMD1P17707 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AMD1P17707 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AMD1P17707 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMD1P17707 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMD1P17707 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMD1P17707 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMD1P17707 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMD1P17707 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMD1P17707 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMD1P17707 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMD1P17707 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AMD1P17707 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AMD1P17707 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AMD1P17707 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AMD1P17707 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AMD1P17707 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AMD1P17707 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AMD1P17707 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMD1P17707 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMD1P17707 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMD1P17707 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMD1P17707 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMD1P17707 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMD1P17707 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMD1P17707 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMD1P17707 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMD1P17707 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMD1P17707 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMD1P17707 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMD1P17707 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMD1P17707 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMD1P17707 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AMD1P17707 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMD1P17707 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMD1P17707 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMD1P17707 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AMD1P17707 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMD1P17707 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMD1P17707 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMD1P17707 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMD1P17707 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMD1P17707 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMD1P17707 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMD1P17707 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMD1P17707 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMD1P17707 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMD1P17707 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMD1P17707 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMD1P17707 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMD1P17707 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMD1P17707 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMD1P17707 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMD1P17707 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AMD1P17707 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMD1P17707 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AMD1P17707 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMD1P17707 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMD1P17707 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMD1P17707 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AMD1P17707 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMD1P17707 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMD1P17707 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMD1P17707 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMD1P17707 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMD1P17707 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMD1P17707 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMD1P17707 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMD1P17707 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMD1P17707 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AMD1P17707 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMD1P17707 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMD1P17707 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMD1P17707 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMD1P17707 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AMD1P17707 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMD1P17707 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMD1P17707 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AMD1P17707 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMD1P17707 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMD1P17707 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMD1P17707 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMD1P17707 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms