Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKACAP17612 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKACAP17612 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKACAP17612 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKACAP17612 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKACAP17612 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKACAP17612 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKACAP17612 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKACAP17612 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKACAP17612 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKACAP17612 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKACAP17612 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRKACAP17612 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKACAP17612 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKACAP17612 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKACAP17612 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKACAP17612 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKACAP17612 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKACAP17612 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKACAP17612 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKACAP17612 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKACAP17612 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKACAP17612 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKACAP17612 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKACAP17612 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKACAP17612 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKACAP17612 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKACAP17612 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKACAP17612 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKACAP17612 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKACAP17612 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKACAP17612 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKACAP17612 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKACAP17612 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms