Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTLA4P16410 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTLA4P16410 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTLA4P16410 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms