Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MUC1P15941 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MUC1P15941 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MUC1P15941 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MUC1P15941 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MUC1P15941 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MUC1P15941 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MUC1P15941 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MUC1P15941 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MUC1P15941 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MUC1P15941 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MUC1P15941 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MUC1P15941 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MUC1P15941 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MUC1P15941 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MUC1P15941 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MUC1P15941 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MUC1P15941 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MUC1P15941 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MUC1P15941 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MUC1P15941 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MUC1P15941 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MUC1P15941 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MUC1P15941 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MUC1P15941 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MUC1P15941 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MUC1P15941 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MUC1P15941 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MUC1P15941 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MUC1P15941 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MUC1P15941 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MUC1P15941 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MUC1P15941 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MUC1P15941 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MUC1P15941 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MUC1P15941 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MUC1P15941 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MUC1P15941 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MUC1P15941 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MUC1P15941 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MUC1P15941 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MUC1P15941 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MUC1P15941 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MUC1P15941 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MUC1P15941 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MUC1P15941 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MUC1P15941 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms