Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA2P15927 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA2P15927 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA2P15927 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPA2P15927 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA2P15927 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA2P15927 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPA2P15927 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA2P15927 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA2P15927 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA2P15927 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA2P15927 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA2P15927 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPA2P15927 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA2P15927 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPA2P15927 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPA2P15927 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA2P15927 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA2P15927 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA2P15927 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA2P15927 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA2P15927 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA2P15927 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA2P15927 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA2P15927 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPA2P15927 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA2P15927 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA2P15927 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA2P15927 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA2P15927 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPA2P15927 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA2P15927 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA2P15927 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA2P15927 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA2P15927 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA2P15927 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA2P15927 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA2P15927 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA2P15927 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPA2P15927 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA2P15927 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA2P15927 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA2P15927 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA2P15927 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA2P15927 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA2P15927 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA2P15927 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA2P15927 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA2P15927 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA2P15927 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA2P15927 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA2P15927 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA2P15927 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA2P15927 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA2P15927 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA2P15927 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA2P15927 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA2P15927 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA2P15927 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA2P15927 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA2P15927 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA2P15927 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA2P15927 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA2P15927 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA2P15927 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA2P15927 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA2P15927 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA2P15927 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA2P15927 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA2P15927 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA2P15927 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA2P15927 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA2P15927 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA2P15927 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA2P15927 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA2P15927 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA2P15927 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA2P15927 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA2P15927 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA2P15927 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA2P15927 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPA2P15927 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA2P15927 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA2P15927 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA2P15927 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA2P15927 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA2P15927 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA2P15927 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPA2P15927 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA2P15927 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA2P15927 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA2P15927 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA2P15927 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA2P15927 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPA2P15927 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA2P15927 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA2P15927 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA2P15927 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA2P15927 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPA2P15927 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms