Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFAPP14136 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GFAPP14136 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFAPP14136 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFAPP14136 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFAPP14136 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFAPP14136 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFAPP14136 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFAPP14136 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFAPP14136 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFAPP14136 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFAPP14136 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFAPP14136 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFAPP14136 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFAPP14136 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFAPP14136 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFAPP14136 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFAPP14136 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GFAPP14136 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFAPP14136 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFAPP14136 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFAPP14136 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFAPP14136 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFAPP14136 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFAPP14136 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFAPP14136 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFAPP14136 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFAPP14136 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFAPP14136 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFAPP14136 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFAPP14136 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFAPP14136 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFAPP14136 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFAPP14136 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFAPP14136 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GFAPP14136 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFAPP14136 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFAPP14136 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFAPP14136 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFAPP14136 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFAPP14136 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFAPP14136 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFAPP14136 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFAPP14136 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFAPP14136 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFAPP14136 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFAPP14136 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFAPP14136 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFAPP14136 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFAPP14136 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFAPP14136 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFAPP14136 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFAPP14136 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFAPP14136 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFAPP14136 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFAPP14136 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFAPP14136 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GFAPP14136 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GFAPP14136 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GFAPP14136 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFAPP14136 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFAPP14136 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFAPP14136 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFAPP14136 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GFAPP14136 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFAPP14136 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFAPP14136 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFAPP14136 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFAPP14136 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GFAPP14136 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFAPP14136 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFAPP14136 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFAPP14136 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFAPP14136 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFAPP14136 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFAPP14136 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GFAPP14136 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFAPP14136 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GFAPP14136 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFAPP14136 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFAPP14136 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFAPP14136 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFAPP14136 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFAPP14136 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFAPP14136 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFAPP14136 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFAPP14136 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFAPP14136 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFAPP14136 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFAPP14136 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms