Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DOBP13765 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DOBP13765 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOBP13765 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOBP13765 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms