Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG2P13727 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG2P13727 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG2P13727 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG2P13727 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG2P13727 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG2P13727 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG2P13727 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG2P13727 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG2P13727 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG2P13727 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG2P13727 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG2P13727 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG2P13727 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG2P13727 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG2P13727 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG2P13727 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG2P13727 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG2P13727 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG2P13727 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG2P13727 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG2P13727 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG2P13727 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG2P13727 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG2P13727 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG2P13727 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG2P13727 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG2P13727 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG2P13727 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG2P13727 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG2P13727 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG2P13727 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG2P13727 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG2P13727 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRG2P13727 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG2P13727 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG2P13727 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG2P13727 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG2P13727 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG2P13727 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG2P13727 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG2P13727 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG2P13727 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG2P13727 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG2P13727 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG2P13727 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG2P13727 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG2P13727 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG2P13727 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG2P13727 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG2P13727 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG2P13727 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG2P13727 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG2P13727 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG2P13727 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG2P13727 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG2P13727 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG2P13727 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG2P13727 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG2P13727 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG2P13727 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG2P13727 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG2P13727 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG2P13727 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG2P13727 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG2P13727 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG2P13727 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG2P13727 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG2P13727 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG2P13727 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG2P13727 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG2P13727 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG2P13727 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG2P13727 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG2P13727 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG2P13727 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG2P13727 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG2P13727 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG2P13727 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG2P13727 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms