Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT13P13646 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT13P13646 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT13P13646 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT13P13646 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT13P13646 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT13P13646 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT13P13646 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT13P13646 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT13P13646 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT13P13646 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT13P13646 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT13P13646 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT13P13646 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT13P13646 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT13P13646 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT13P13646 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT13P13646 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT13P13646 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT13P13646 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT13P13646 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT13P13646 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT13P13646 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT13P13646 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT13P13646 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT13P13646 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT13P13646 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT13P13646 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT13P13646 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT13P13646 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT13P13646 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT13P13646 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT13P13646 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT13P13646 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT13P13646 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT13P13646 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT13P13646 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT13P13646 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT13P13646 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT13P13646 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT13P13646 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT13P13646 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT13P13646 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT13P13646 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT13P13646 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT13P13646 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT13P13646 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT13P13646 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT13P13646 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT13P13646 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT13P13646 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT13P13646 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT13P13646 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT13P13646 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT13P13646 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT13P13646 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT13P13646 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT13P13646 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT13P13646 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT13P13646 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT13P13646 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT13P13646 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT13P13646 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT13P13646 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT13P13646 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT13P13646 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT13P13646 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT13P13646 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT13P13646 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT13P13646 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT13P13646 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT13P13646 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT13P13646 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT13P13646 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT13P13646 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT13P13646 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT13P13646 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT13P13646 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT13P13646 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT13P13646 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT13P13646 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT13P13646 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT13P13646 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT13P13646 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT13P13646 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT13P13646 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT13P13646 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT13P13646 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT13P13646 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT13P13646 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT13P13646 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT13P13646 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT13P13646 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT13P13646 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT13P13646 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT13P13646 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT13P13646 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT13P13646 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT13P13646 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT13P13646 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms