Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPREB1P12018 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms