Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSH2P0DML3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSH2P0DML3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSH2P0DML3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSH2P0DML3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms