Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGA3P0DJD8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGA3P0DJD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGA3P0DJD8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGA3P0DJD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms