Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR35P0CG20 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRR35P0CG20 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR35P0CG20 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR35P0CG20 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms